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Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包

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Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包

小编给大家分享一下Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包,相信大部分人都还不怎么了解,因此分享这篇文章给大家参考一下,希望大家阅读完这篇文章后大有收获,下面让我们一起去了解一下吧!

    1. 预先准备

    Windows下需要安装Rtools,R中装好Rcpp和RcppArmadillo。创建C++源文件func.cpp,自定义头文件test_h.h

    源文件示例func.cpp

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]#include <RcppArmadillo.h>#include <vector>#include "./test_h.h"using namespace Rcpp;using namespace std;// using namespace arma;// [[Rcpp::export]]RObject func(){  arma::cube A(3,4,5,arma::fill::randu);  std::cout<<CONDIT<<std::endl;  return wrap(A);}

    // [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]:用于指明需要使用RcppArmadillo。

    // [[Rcpp::plugins(cpp11)]]:指明需要使用C++11。

    #include "./test_h.h":表示使用第三方头文件。第三方头文件需要用双引号""包括起来,并加上.h./表示在当下文件夹(class="lazy" data-src)下搜寻文件。

    // using namespace arma;不一定有用。如果要用Armadillo的数据结构,在其之前需指明arma::

    func()函数将可以直接在R中调用。

    头文件示例test_h.h

     

    #include <iostream>#define CONDIT 1000

    2. 创建R包步骤

    新建R Package

    Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包

    选择Package w/Rcpp, 并添加源文件。或者建立包以后,手动复制到class="lazy" data-src文件夹下。

    Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包

    R包的文件结构

    Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包

    修改DESCRIPTION文件

    将RcppArmadillo添加进Imports和LinkingTo中。

    Package: RcppPackTestType: PackageTitle: What the Package Does (Title Case)Version: 0.1.0Author: Who wrote itMaintainer: The package maintainer <yourself@somewhere.net>Description: More about what it does (maybe more than one line)    Use four spaces when indenting paragraphs within the Description.License: What license is it under?Encoding: UTF-8LazyData: trueImports: Rcpp (>= 0.12.11), RcppArmadilloLinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo

    Build & Reload 建立包

    3. C++11标准问题

    如果要使用C++11标准,第一种方法是在Makevars文件中添加如下代码:

    CXX = g++-4.8.1PKG_CXXFLAGS = -std=c++11

    第二种方法是在.cpp文件前添加// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]

    以上是“Rcpp和RcppArmadillo如何创建R语言包”这篇文章的所有内容,感谢各位的阅读!相信大家都有了一定的了解,希望分享的内容对大家有所帮助,如果还想学习更多知识,欢迎关注编程网行业资讯频道!

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