MongoDB实例重启失败探究（大事务Redo导致）

 1.实例重启背景

收到监控组同学反馈，连接某一个MongoDB实例的应用耗时异常，并且出现了超时。查看数据库监控平台，发现此实例服务器的IO异常飙升，而查看副本集状态(rs.status()),主从是坏掉的，从节点不可达。

登入从节点，查看mongodb服务状态，是stop的。

查看服务器的log，发现出现了OOM，Mongodb被关闭了。需要手动重启。

Jan 17 12:02:48 qqorderdb02 kernel: Out of memory: Kill process 83717 (mongod) score 919 or sacrifice child
Jan 17 12:02:48 qqorderdb02 kernel: Killed process 83717 (mongod), UID 1001, total-vm:21256876kB, anon-rss:15529572kB, file-rss:0kB, shmem-rss:0kB
Jan 17 12:42:42 qqorderdb02 systemd[1]: mongodbqq.service: main process exited, code=killed, status=9/KILL
Jan 17 12:42:42 qqorderdb02 systemd[1]: Unit mongodbqq.service entered failed state.
Jan 17 12:42:42 qqorderdb02 systemd[1]: mongodbqq.service failed.

事后分析，主节点的内存比从节点的内存大，创建索引，主节点正常执行了，而从节点出席那了OOM（12:02），KIll后，服务自启动也失败了（12:42）。

 2.重启服务

重启，查看mongodblog，我们会看到redo未提交的创建索引的事务

2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten] ** WARNING: /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled is "always".
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten] **        We suggest setting it to "never"
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten]
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten] ** WARNING: /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/defrag is "always".
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten] **        We suggest setting it to "never"
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten]
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten] ** WARNING: Running wiredTiger with the --nojournal option in a replica set
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten] **          is deprecated and subject to be removed in a future version.
2019-01-17T19:38:11.529+0800 I CONTROL  [initandlisten]
2019-01-17T19:38:11.592+0800 I INDEX    [initandlisten] found 1 index(es) that wasn"t finished before shutdown
2019-01-17T19:38:11.595+0800 I FTDC     [initandlisten] Initializing full-time diagnostic data capture with directory "/var/mongodbqq/db/diagnostic.data"
2019-01-17T19:38:11.596+0800 I INDEX    [initandlisten] found 1 interrupted index build(s) on qqorderdb.weixinordersn
2019-01-17T19:38:11.596+0800 I INDEX    [initandlisten] note: restart the server with --noIndexBuildRetry to skip index rebuilds

 但执行一会后，重启失败，退出。查看server log，报错信息如下：

Jan 17 19:41:10 qqorderdb02 systemd[1]: mongodbqq.service stop-final-sigterm timed out. Killing.
Jan 17 19:41:10 qqorderdb02 systemd[1]: Failed to start mongodbqq_service.
Jan 17 19:41:10 qqorderdb02 systemd[1]: Unit mongodbqq.service entered failed state.
Jan 17 19:41:10 qqorderdb02 systemd[1]: mongodbqq.service failed.

查看mongodb的log，最新的信息如下:

2019-01-17T19:41:00.001+0800 I -        [initandlisten]   Index Build: 55387600/192576426 28%
2019-01-17T19:41:03.002+0800 I -        [initandlisten]   Index Build: 57463100/192576426 29%
2019-01-17T19:41:06.002+0800 I -        [initandlisten]   Index Build: 59385700/192576426 30%
2019-01-17T19:41:09.001+0800 I -        [initandlisten]   Index Build: 61549000/192576426 31%

通过查看Server log 和 Mongodb log ,我们可以判断：启动时需要重建关闭时未完成的index，但是重建这个大集合（本案例为weixinordersn，5亿数据量，102Gsize）的索引耗时较长，超过了启动服务允许的时间。服务超时后会被killed。

3.解决方案

设置systemd的service超时时间，在mongodb服务中，指明TimeoutSec参数。

TimeoutSec：定义 Systemd 停止当前服务之前等待的秒数。单位是秒，设置为0是不限制.

例如mongodbtest.service的编写，增加 TimeoutSec=1800

[Unit]
 
Description=mongodbtest
After=network.target remote-fs.target nss-lookup.target
[Service]
User=mongouser
Group=mongouser
# (open files)
LimitNOFILE=64000
Type=forking
ExecStart=/data/mongodb/mongobin404/bin/mongod --config /data/mongodb/mongobin404/bin/mongodbtest.conf
ExecReload=/bin/kill -s HUP $MAINPID
ExecStop=/data/mongodb/mongobin404/bin/mongod --shutdown --config /data/mongodb/mongobin404/bin/mongodbtest.conf
PrivateTmp=true
TimeoutSec=1800
 
[Install]
WantedBy=multi-user.target

4.性能下降的分析

结合 应用超时 和 数据库监控的IO飙升的时间关联，性能下降主要分别是 创建索引 和 主从断掉导致oplog.rs 插入、查询、更新变慢导致。

5.参考文献

https://cloudblue.freshdesk.com/support/solutions/articles/44001881778

https://www.cnblogs.com/f-society/p/13177614.html

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