详解Matlab如何绘制小提琴图
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写了个matlab绘制小提琴图的函数:
1.图中小提琴状区域为核密度曲线
2.白色方块为25%,75%分位数
3.中间横线为中位数
4.白色点为离群值点
5.竖着的黑线是去掉离群值点后点的上下限
1使用示例
基础使用,Y为矩阵
X=1:5;
Y=randn(100,5);
Hdl1=violinChart(gca,X,Y,[0 0.447 0.741],0.6);
- X:横坐标
- Y:数据集
- FaceColor :颜色,示例用的是[0 0.447 0.741]
- width : 小提琴图宽度,这里取的是0.6,就是以两个小提琴图间距的0.6倍为概率密度的上限1
基础使用,Y为向量,X为标签
X=[1.*ones(1,50),2.*ones(1,30),3.*ones(1,20),4.*ones(1,50),5.*ones(1,50)];
Y=randn(1,200)+sin(X);
Hdl=violinChart(gca,X,Y,[0 0.447 0.741]);
基础使用多个图像绘制,并添加图例
X1=[1:2:7,13];
Y1=randn(100,5)+sin(X1);
X2=2:2:10;
Y2=randn(100,5)+cos(X2);
figure
Hdl1=violinChart(gca,X1,Y1,[0 0.447 0.741]);
Hdl2=violinChart(gca,X2,Y2,[0.850 0.325 0.098]);
legend([Hdl1.F_legend,Hdl2.F_legend],{'randn+sin(x)','randn+cos(x)'});
2完整代码
function Hdl=violinChart(ax,X,Y,FaceColor,width)
% @author slandarer
% Hdl: 返回的图形对象句柄结构体
% - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
% Hdl.F_density(i) | patch | 核密度分布
% Hdl.F_outlier(i) | scatter | 离群值点
% Hdl.F_range95(i) | line | 去除离群值点后最大值及最小值
% Hdl.F_quantile(i) | patch | 四分位数框
% Hdl.F_medianLine(i)| line | 中位数
%
% Hdl.F_legend | patch | 用于生成legend图例的图形对象
% - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
% 请使用如下方式生成图例:
% Hdl1=violinChart(ax,X,Y,... ...)
% Hdl2=violinChart(ax,X,Y,... ...)
% ... ...
% legend([Hdl1,Hdl2,... ...],{Name1,Name2,...})
% ===========================================================
% 以下为使用实例代码:
% - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
% X1=[1:2:7,13];
% Y1=randn(100,5)+sin(X1);
% X2=2:2:10;
% Y2=randn(100,5)+cos(X2);
%
% Hdl1=violinChart(gca,X1,Y1,[0 0.447 0.741],0.5);
% Hdl2=violinChart(gca,X2,Y2,[0.850 0.325 0.098],0.5);
% legend([Hdl1.F_legend,Hdl2.F_legend],{'randn+sin(x)','randn+cos(x)'});
if nargin<5
width=0.4;
end
if ~isempty(ax)
else
ax=gca;
end
hold(ax,'on');
oriX=X;
X=unique(X);
sep=min(diff(X));
if isempty(sep)
sep=1;
end
for i=1:length(X)
if length(oriX)==numel(Y)
tY=Y(oriX==X(i));
else
tY=Y(:,i);
end
[f,yi]=ksdensity(tY);
Hdl.F_density(i)=fill([f,-f(end:-1:1)].*sep.*width+X(i),[yi,yi(end:-1:1)],FaceColor);
outliBool=isoutlier(tY,'quartiles');
outli=tY(outliBool);
Hdl.F_outlier(i)=scatter(repmat(X(i),[length(outli),1]),outli,20,'filled',...
'CData',[1 1 1],'MarkerEdgeColor','none');
nY=tY(~outliBool);
Hdl.F_range95(i)=plot([X(i),X(i)],[min(nY),max(nY)],'k','lineWidth',1);
qt25=quantile(tY,0.25);
qt75=quantile(tY,0.75);
Hdl.F_quantile(i)=fill(X(i)+0.6.*sep.*width.*[-1 1 1 -1].*max(f),...
[qt25,qt25,qt75,qt75],[1 1 1],...
'EdgeColor',[0 0 0]);
med=median(tY);
Hdl.F_medianLine(i)=plot(X(i)+0.6.*sep.*width.*[-1 1].*max(f),[med,med],'LineWidth',3,...
'Color',[0 0 0]);
end
Hdl.F_legend=Hdl.F_density(1);
end
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