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py3nvml实现GPU相关信息读取的案例分析

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py3nvml实现GPU相关信息读取的案例分析

在深度学习或者其他类型的GPU运算过程中,对于GPU信息的监测也是一个非常常用的功能。如果仅仅是使用系统级的GPU监测工具,就没办法非常细致的去跟踪每一步的显存和使用率的变化。如果是用profiler,又显得过于细致,而且环境配置、信息输出和筛选并不是很方便。此时就可以考虑使用py3nvml这样的工具,针对于GPU任务执行的过程进行细化的分析,有助于提升GPU的利用率和程序执行的性能。

技术背景

随着模型运算量的增长和硬件技术的发展,使用GPU来完成各种任务的计算已经渐渐成为算法实现的主流手段。而对于运行期间的一些GPU的占用,比如每一步的显存使用率等诸如此类的信息,就需要一些比较细致的GPU信息读取的工具,这里我们重点推荐使用py3nvml来对python代码运行的一个过程进行监控。

常规信息读取

一般大家比较常用的就是nvidia-smi这个指令,来读取GPU的使用率和显存占用、驱动版本等信息:


$ nvidia-smi
Wed Jan 12 15:52:04 2022
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 470.42.01    Driver Version: 470.42.01    CUDA Version: 11.4     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                               |                      |               MIG M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:03:00.0  On |                  N/A |
| 30%   39C    P8    20W / 125W |    538MiB /  7979MiB |     16%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
|   1  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:A6:00.0 Off |                  N/A |
| 30%   32C    P8     7W / 125W |      6MiB /  7982MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                  |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                  GPU Memory |
|        ID   ID                                                   Usage      |
|=============================================================================|
|    0   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                412MiB |
|    0   N/A  N/A      2940      G   /usr/bin/gnome-shell               76MiB |
|    0   N/A  N/A     47102      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       35MiB |
|    0   N/A  N/A    172424      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       11MiB |
|    1   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                  4MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

但是如果不使用profile仅仅使用nvidia-smi这个指令的输出的话,是没有办法非常细致的分析程序运行过程中的变化的。这里顺便推荐一个比较精致的跟nvidia-smi用法非常类似的小工具:gpustat。这个工具可以直接使用pip进行安装和管理:

$ python3 -m pip install gpustat
Collecting gpustat
  Downloading gpustat-0.6.0.tar.gz (78 kB)
     |████████████████████████████████| 78 kB 686 kB/s
Requirement already satisfied: six>=1.7 in /home/dechin/.local/lib/python3.8/site-packages (from gpustat) (1.16.0)
Collecting nvidia-ml-py3>=7.352.0
  Downloading nvidia-ml-py3-7.352.0.tar.gz (19 kB)
Requirement already satisfied: psutil in /home/dechin/.local/lib/python3.8/site-packages (from gpustat) (5.8.0)
Collecting blessings>=1.6
  Downloading blessings-1.7-py3-none-any.whl (18 kB)
Building wheels for collected packages: gpustat, nvidia-ml-py3
  Building wheel for gpustat (setup.py) ... done
  Created wheel for gpustat: filename=gpustat-0.6.0-py3-none-any.whl size=12617 sha256=4158e741b609c7a1bc6db07d76224db51cd7656a6f2e146e0b81185ce4e960ba
  Stored in directory: /home/dechin/.cache/pip/wheels/0d/d9/80/b6cbcdc9946c7b50ce35441cc9e7d8c5a9d066469ba99bae44
  Building wheel for nvidia-ml-py3 (setup.py) ... done
  Created wheel for nvidia-ml-py3: filename=nvidia_ml_py3-7.352.0-py3-none-any.whl size=19191 sha256=70cd8ffc92286944ad9f5dc4053709af76fc0e79928dc61b98a9819a719f1e31
  Stored in directory: /home/dechin/.cache/pip/wheels/b9/b1/68/cb4feab29709d4155310d29a421389665dcab9eb3b679b527b
Successfully built gpustat nvidia-ml-py3
Installing collected packages: nvidia-ml-py3, blessings, gpustat
Successfully installed blessings-1.7 gpustat-0.6.0 nvidia-ml-py3-7.352.0

使用的时候也是跟nvidia-smi非常类似的操作:

$ watch --color -n1 gpustat -cpu 

返回结果如下所示:

Every 1.0s: gpustat -cpu                   ubuntu2004: Wed Jan 12 15:58:59 2022

ubuntu2004           Wed Jan 12 15:58:59 2022  470.42.01
[0] Quadro RTX 4000  | 39'C,   3 % |   537 /  7979 MB | root:Xorg/1643(412M) de
chin:gnome-shell/2940(75M) dechin:slack/47102(35M) dechin:chrome/172424(11M)
[1] Quadro RTX 4000  | 32'C,   0 % |     6 /  7982 MB | root:Xorg/1643(4M)

通过gpustat返回的结果,包含了GPU的型号、使用率和显存使用大小和GPU当前的温度等常规信息。

py3nvml的安装与使用

接下来正式看下py3nvml的安装和使用方法,这是一个可以在python中实时查看和监测GPU信息的一个库,可以通过pip来安装和管理:

$ python3 -m pip install py3nvml
Collecting py3nvml
  Downloading py3nvml-0.2.7-py3-none-any.whl (55 kB)
     |████████████████████████████████| 55 kB 650 kB/s
Requirement already satisfied: xmltodict in /home/dechin/anaconda3/lib/python3.8/site-packages (from py3nvml) (0.12.0)
Installing collected packages: py3nvml
Successfully installed py3nvml-0.2.7

py3nvml绑定GPU卡

有一些框架为了性能的最大化,在初始化的时候就会默认去使用到整个资源池里面的所有GPU卡,比如如下使用Jax来演示的一个案例:


In [1]: import py3nvml

In [2]: from jax import numpy as jnp

In [3]: x = jnp.ones(1000000000)

In [4]: !nvidia-smi
Wed Jan 12 16:08:32 2022
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 470.42.01    Driver Version: 470.42.01    CUDA Version: 11.4     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                               |                      |               MIG M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:03:00.0  On |                  N/A |
| 30%   41C    P0    38W / 125W |   7245MiB /  7979MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
|   1  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:A6:00.0 Off |                  N/A |
| 30%   35C    P0    35W / 125W |    101MiB /  7982MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                  |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                  GPU Memory |
|        ID   ID                                                   Usage      |
|=============================================================================|
|    0   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                412MiB |
|    0   N/A  N/A      2940      G   /usr/bin/gnome-shell               75MiB |
|    0   N/A  N/A     47102      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       35MiB |
|    0   N/A  N/A    172424      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       11MiB |
|    0   N/A  N/A    812125      C   /usr/local/bin/python            6705MiB |
|    1   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                  4MiB |
|    1   N/A  N/A    812125      C   /usr/local/bin/python              93MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

在这个案例中我们只是在显存中分配了一块空间用于存储一个向量,但是Jax在初始化之后,自动占据了本地的2张GPU卡。根据Jax官方提供的方法,我们可以使用如下的操作配置环境变量,使得Jax只能看到其中的1张卡,这样就不会扩张:

In [1]: import os

In [2]: os.environ["CUDA_VISIBLE_DEVICES"] = "1"

In [3]: from jax import numpy as jnp

In [4]: x = jnp.ones(1000000000)

In [5]: !nvidia-smi
Wed Jan 12 16:10:36 2022
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 470.42.01    Driver Version: 470.42.01    CUDA Version: 11.4     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                               |                      |               MIG M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:03:00.0  On |                  N/A |
| 30%   40C    P8    19W / 125W |    537MiB /  7979MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
|   1  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:A6:00.0 Off |                  N/A |
| 30%   35C    P0    35W / 125W |   7195MiB /  7982MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                  |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                  GPU Memory |
|        ID   ID                                                   Usage      |
|=============================================================================|
|    0   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                412MiB |
|    0   N/A  N/A      2940      G   /usr/bin/gnome-shell               75MiB |
|    0   N/A  N/A     47102      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       35MiB |
|    0   N/A  N/A    172424      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       11MiB |
|    1   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                  4MiB |
|    1   N/A  N/A    813030      C   /usr/local/bin/python            7187MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

可以看到结果中已经是只使用了1张GPU卡,达到了我们的目的,但是这种通过配置环境变量来实现的功能还是着实不够pythonic,因此py3nvml中也提供了这样的功能,可以指定某一系列的GPU卡用于执行任务:

In [1]: import py3nvml

In [2]: from jax import numpy as jnp

In [3]: py3nvml.grab_gpus(num_gpus=1,gpu_select=[1])
Out[3]: 1

In [4]: x = jnp.ones(1000000000)

In [5]: !nvidia-smi
Wed Jan 12 16:12:37 2022
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI 470.42.01    Driver Version: 470.42.01    CUDA Version: 11.4     |
|-------------------------------+----------------------+----------------------+
| GPU  Name        Persistence-M| Bus-Id        Disp.A | Volatile Uncorr. ECC |
| Fan  Temp  Perf  Pwr:Usage/Cap|         Memory-Usage | GPU-Util  Compute M. |
|                               |                      |               MIG M. |
|===============================+======================+======================|
|   0  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:03:00.0  On |                  N/A |
| 30%   40C    P8    20W / 125W |    537MiB /  7979MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+
|   1  Quadro RTX 4000     On   | 00000000:A6:00.0 Off |                  N/A |
| 30%   36C    P0    35W / 125W |   7195MiB /  7982MiB |      0%      Default |
|                               |                      |                  N/A |
+-------------------------------+----------------------+----------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                                  |
|  GPU   GI   CI        PID   Type   Process name                  GPU Memory |
|        ID   ID                                                   Usage      |
|=============================================================================|
|    0   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                412MiB |
|    0   N/A  N/A      2940      G   /usr/bin/gnome-shell               75MiB |
|    0   N/A  N/A     47102      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       35MiB |
|    0   N/A  N/A    172424      G   ...AAAAAAAAA= --shared-files       11MiB |
|    1   N/A  N/A      1643      G   /usr/lib/xorg/Xorg                  4MiB |
|    1   N/A  N/A    814673      C   /usr/local/bin/python            7187MiB |
+-----------------------------------------------------------------------------+

可以看到结果中也是只使用了1张GPU卡,达到了跟上一步的操作一样的效果。

查看空闲GPU

对于环境中可用的GPU,py3nvml的判断标准就是在这个GPU上已经没有任何的进程,那么这个就是一张可用的GPU卡:

In [1]: import py3nvml

In [2]: free_gpus = py3nvml.get_free_gpus()

In [3]: free_gpus
Out[3]: [True, True]

当然这里需要说明的是,系统应用在这里不会被识别,应该是会判断守护进程。

命令行信息获取

nvidia-smi非常类似的,py3nvml也可以在命令行中通过调用py3smi来使用。值得一提的是,如果需要用nvidia-smi来实时的监测GPU的使用信息,往往是需要配合watch -n来使用的,但是如果是py3smi则不需要,直接用py3smi -l就可以实现类似的功能。

$ py3smi -l 5
Wed Jan 12 16:17:37 2022
+-----------------------------------------------------------------------------+
| NVIDIA-SMI                        Driver Version: 470.42.01                 |
+---------------------------------+---------------------+---------------------+
| GPU Fan  Temp Perf Pwr:Usage/Cap|        Memory-Usage | GPU-Util Compute M. |
+=================================+=====================+=====================+
|   0 30%   39C    8   19W / 125W |   537MiB /  7979MiB |       0%    Default |
|   1 30%   33C    8    7W / 125W |     6MiB /  7982MiB |       0%    Default |
+---------------------------------+---------------------+---------------------+

+-----------------------------------------------------------------------------+
| Processes:                                                       GPU Memory |
| GPU        Owner      PID      Uptime  Process Name                   Usage |
+=============================================================================+
+-----------------------------------------------------------------------------+

可以看到略有区别的是,这里并不像nvidia-smi列出来的进程那么多,应该是自动忽略了系统进程。

单独查看驱动版本和显卡型号

在py3nvml中把查看驱动和型号的功能单独列了出来:

In [1]: from py3nvml.py3nvml import *
In [2]: nvmlInit()
Out[2]: <CDLL 'libnvidia-ml.so.1', handle 560ad4d07a60 at 0x7fd13aa52340>
In [3]: print("Driver Version: {}".format(nvmlSystemGetDriverVersion()))
Driver Version: 470.42.01
In [4]: deviceCount = nvmlDeviceGetCount()
   ...: for i in range(deviceCount):
   ...:     handle = nvmlDeviceGetHandleByIndex(i)
   ...:     print("Device {}: {}".format(i, nvmlDeviceGetName(handle)))
   ...:
Device 0: Quadro RTX 4000
Device 1: Quadro RTX 4000
In [5]: nvmlShutdown()

这样也不需要我们自己再去逐个的筛选,从灵活性和可扩展性上来说还是比较方便的。

单独查看显存信息

这里同样的也是把显存的使用信息单独列了出来,不需要用户再去单独筛选这个信息,相对而言比较细致:

In [1]: from py3nvml.py3nvml import *
In [2]: nvmlInit()
Out[2]: <CDLL 'libnvidia-ml.so.1', handle 55ae42aadd90 at 0x7f39c700e040>
In [3]: handle = nvmlDeviceGetHandleByIndex(0)
In [4]: info = nvmlDeviceGetMemoryInfo(handle)
In [5]: print("Total memory: {}MiB".format(info.total >> 20))
Total memory: 7979MiB
In [6]: print("Free memory: {}MiB".format(info.free >> 20))
Free memory: 7441MiB
In [7]: print("Used memory: {}MiB".format(info.used >> 20))
Used memory: 537MiB

如果把这些代码插入到程序中,就可以获悉每一步所占用的显存的变化。

总结概要

在深度学习或者其他类型的GPU运算过程中,对于GPU信息的监测也是一个非常常用的功能。如果仅仅是使用系统级的GPU监测工具,就没办法非常细致的去跟踪每一步的显存和使用率的变化。如果是用profiler,又显得过于细致,而且环境配置、信息输出和筛选并不是很方便。此时就可以考虑使用py3nvml这样的工具,针对于GPU任务执行的过程进行细化的分析,有助于提升GPU的利用率和程序执行的性能。

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参考链接

https://zhuanlan.zhihu.com/p/31558973 “留一手”加剧内卷,“讲不清”浪费时间。

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